Lite systematik i Newtonbloggarens baraminologi

Här är ett fylogenetiskt träd (Neigbor joining) över mitokondrie-DNA från de flesta av de arter (plus några till) som omnämns i Newtonbloggaren Johannes Axelssons Evo-Lattjolajbanlåda. EDIT: Se också Thomas Schwartz alternativa träd nedan. Axelssons naiva hantering av biologiska likheter och skillnader har jag kommenterat specifikt här, och denna bloggsida utgör referensmaterialet till mina kommentarer på Newtonbloggen.

Vissa arter fanns inte tillgängliga, och har i görligaste mån ersatts av närbesläktade arter. Dessutom har jag missat någon (bland annat flodhästen) i hastigheten.

Mitokondrie-sekvenserna har hämtats på NCBI. Passningar av DNA-sekvenser och fylogenin har gjorts med MEGA 5.1 som finns att ladda ner gratis från nätet. Det här kan alltså vem som helst göra själv, med lite handledning.

Axelsson har några felaktigheter bland sina artnamn. Framför allt har han felaktigt angett ett nam på en ökenguldmullvad som troligen är Eremitalpa granti som Taupe doree.

ALLA placentala däggdjur bildar en monofyletisk grupp (där alla inom gruppen är närmast släkt med varandra) som är skild från en annan monofyletisk grupp som omfattar ALLA pungdjuren. Myrpiggsvinet (Tachyglossus aculeatus – Monotremata) bildar en egen linje skild från alla de andra. Enda brasklappen är att myrpiggsvinet här utgör en systergrupp till pungdjuren, istället för att forma en utgrupp till både pungdjur och placentala däggdjur.

Inom de placentala däggdjuren faller de grupper ut som man kan förvänta sig, även om man får ta de basala grenarnas ordning med en nypa salt:

De partåiga klövdjuren bildar en egen grupp, med antiloper etc. på ena sidan, och grisar och deras släktingar snyggt placerade på den andra. Notera att peccarys (navelsvin) mycket riktigt utgör en egen systergrupp som är skild från grisarna, vilket också är uppenbart baserat på morfologiska skillnader (bland annat tänderna). Notera inte minst att valar är klövdjur som har simmat ut i havet och tappat benen.

Rovdjuren bildar en snygg monofyletisk grupp, med hunddjuren som en egen ”baramin”? – nej tätt flankerad av björnar och hyenor. Likaså aporna, så klart, även om jag inte köper sengångaren som en systergrupp till aporna. Gnagarna hamnar också hyfsat snyggt tillsammans. Murmeldjuret och flygekorren (en europeisk variant) bildar en egen grupp, vilket är precis vad man kan förvänta sig; de är ju trots allt samma familj, dvs de är alla (placentala) ekorrar. Murmeldjuret är helt enkelt en ekorre som har släppt den långa yviga svansen och skaffat sig en viss rondör. Den ytliga likheten mellan murmeldjuren och vombaterna (pungdjur) känns med andra ord inte som något att hetsa upp sig över.

När man hittar tre ”mullvadar” utspridda i fylogenin så känns inte heller deras konvergenta evolution som något särskilt anmärkningsvärt. Titta hur de ser ut – så lika är de tamejfan inte. Som vanligt bara väldigt ytliga likheter.

 

Bilden ovan är Thomas Schwartz fylogeni med liknande urval arter, med höns som utgrupp och med bootstrap-värden som visar ungefär styrkan i de enskilda fylogenetiska arrangemangen.

Inlägg	Art	Trivialnamn	Typ	Grupp	Mitokondrie
EvLLL 1	Petaurus breviceps	Flygpungekorre	Marsupial		Ja
EvLLL 1	Glaucomys volans	Mindre Nordamerikansk flygekorre	Placental	Sciuridae	Nej
EvLLL 1	Glaucomys sabrinus	Annan amerikansk flygekorre	Placental	Sciuridae	Nej
EvLLL 1	Pteromys volans	Flygekorre (Europeisk)	Placental	Sciuridae	Ja
EvLLL 1	Orcinus orca	Späckhuggare	Placental	Tandval	Ja
EvLLL 2	Lasiorhinus latifrons	Hårnosvombat	Marsupial	Vombatidae	Nej
EvLLL 2	Vombatus ursinus	Vombat	Marsupial	Vombatidae	Ja
EvLLL 2	Marmota himalayana	Murmeldjur	Placental	Sciuridae	Ja
EvLLL 2	Sarcophilus harrisii	Pungdjävul	Marsupial	Dasyuridae	Ja
EvLLL 3	Eremitalpa grantii	Golden mole	Placental	Chrysocloridae	Ja	Taupe doree????
EvLLL 3	Talpa europea	Mullvad	Placental	Talpidae	Ja
EvLLL 3	Notoryctes typhlops	Pungmullvad	Marsupial	Notoryctidae	Ja
EvLLL 3	Alces alces	Älg	Placental	Cervidae	Ja
EvLLL 4	Thylacinus cynocephalus	Pungvarg	Marsupial	Thylacinidae	Ja
EvLLL 4	Hyaena hyaena	Hyena	Placental	Hyaenidae	Ja
EvLLL 4	Lycaon pictus	Afrikansk Vildhund	Placental	Canidae	Nej
EvLLL 4	Nyctereutes procyonoides	Mårdhund	Placental	Canidae	Ja
EvLLL 4	Canis lupus	Hund, Varg	Placental	Canidae	Ja
EvLLL 4	Vulpes vulpes	Räv	Placental	Canidae	Ja
EvLLL 4	Hippopotamus amphibius	Flodhäst	Placental	Hippopotamidae	Ja
EvLLL 5	Lemniscomys striatus	Striped grass mouse	Placental	Muridae	Nej	Lemniscopys???
EvLLL 5	Rattus norvegicus	Råtta	Placental	Muridae	Ja
EvLLL 5	Hypsiprymnodon moschatus	Myskkänguru	Marsupial	Hypsiprymnodontidae	Nej
EvLLL 5	Macropus robustus	Känguru	Marsupial	Macropodidae	Ja
EvLLL 5	Heterocephalus glaber	Nakenråtta	Placental	Bathyergidae	Ja
EvLLL 5	Thryonomys swinderianus	Greater cane rat	Placental	Thryonomyidae	Ja
EvLLL 6	Hystrix cristata	Piggsvin	Placental	Hystricidae	Nej
EvLLL 6	Erinaceus europaeus	Igelkott	Placental	Erinaceidae	Ja
EvLLL 6	Tachyglossus aculeatus	Myrpiggsvin	Monotremata	Tachyglossidae	Ja
EvLLL 6	Hylobates lar	Gibon	Placental	Hylobatidae	Ja
EvLLL 7	Pecari tajacu	Navelsvin	Placental	Tayassuidae	Ja
EvLLL 7	Sus scrofa	Vildsvin	Placental	Suidae	Ja
EvLLL 7	Phacochoerus africanus	Vårtsvin	Placental	Suidae	Ja
EvLLL 7	Potamochoerus porcus	Penselsvin	Placental	Suidae	Ja
EvLLL 8	Tapirus indicus	Tapir	Placental	Tapiridae	Nej
EvLLL 8	Babirousa celebensis	Babirousa	Placental	Suidae	Nej
EvLLL 8	Giraffa camelopardis	Giraff	Placental	Giraffidae	Ja
EvLLL 9	Antilocapra americana	Pronghorn (amerikansk)	Placental	Antilocapridae	Ja
EvLLL 9	Gazella gazella	Gazell	Placental	Bovidae, Antilopinae	Ja
EvLLL 9	Antidorcas marsupialis	Springbok	Placental	Bovidae, Antilopinae	Ja
EvLLL 9	Bison bison	Bison	Placental	Bovidae, Bovinae	Ja
EvLLL 10	Ailuropoda melanoleuca	Jättepanda	Placental	Ursidae	Ja
EvLLL 10	Colobus guereza	Colobusapa	Placental	Cercopithecidae	Ja
EvLLL 10	Bradypus tridactylus	Sengångare	Placental	Bradypodidae	Ja
EvLLL 10	Phascolarctos cinereus	Koala	Marsupial	Phascolarctidae	Ja